En el 1194 se habla por primera vez de la existencia de unos baños públicos en Girona. En 1285, debido al asedio de las tropas de Felipe el Atrevido de Francia, el complejo es parcialmente destruido. En 1294 el rey Jaime II encargó su reconstrucción a Ramon Taialà, ciudadano de Girona. En 1342 eran propiedad de Arnau Sarriera, médico personal de Pedro III el Ceremonioso. Parece que durante la Edad Media una parte de los baños sirvió, temporalmente, de micvé por la comunidad judía de la ciudad. En 1618 fueron adquiridos por una comunidad de monjas capuchinas, que lo convirtieron en parte de su clausura. En el siglo XIX fueron objeto de interés y estudio de los primeros grandes viajeros, como Alexandre de Laborde, quién los dio a conocer en el mundo incluyendo dibujos y grabados en sus obras. Posteriormente, los diversos estudios de Josep Puig i Cadafalch fueron la base científica para la adquisición por parte de la Diputación de Girona, en 1929. La Diputación promovió su restauración, y fueron abiertos al público en 1932.